答：契税的计税依据中已包含耕地占用税，不用另外加上。

《关于贯彻实施契税法若干事项执行口径的公告》（财政部 税务总局公告2021年第23号）第二条第五项规定，土地使用权出让的，计税依据包括土地出让金、土地补偿费、安置补助费、地上附着物和青苗补偿费、征收补偿费、城市基础设施配套费、实物配建房屋等应交付的货币以及实物、其他经济利益对应的价款。

根据《土地管理法》和《国务院关于促进节约集约用地的通知》（国发〔2018〕7号）的有关规定，未利用的土地出让前，应当完成必须必要的前期开发，经过前期开发的土地，才能依法由市、县人民政府对国土资源部门统一组织出让。因此耕地占用税在土地出让前就该缴纳。

具体由谁来交？根据《中华人民共和国耕地占用税法》规定，在中华人民共和国境内占用耕地建设建筑物、构筑物或者从事非农业建设的单位和个人，为耕地占用税的纳税人。《中华人民共和国耕地占用税法实施办法》（财政部公告2019年第81号)第二条规定，经批准占用耕地的，纳税人为农用地转用审批文件中标明的建设用地人；农用地转用审批文件中未标明建设用地人的，纳税人为用地申请人，其中用地申请人为各级人民政府的，由同级土地储备中心、自然资源主管部门或政府委托的其他部门、单位履行耕地占用税申报纳税义务。未经批准占用耕地的，纳税人为实际用地人。

可以区分为两种情形：

情形一：由自然资源局缴纳

经批准占用耕地的，纳税人为农用地转用审批文件中标明的建设用地人。地方政府为招商引资以政府名义征收耕地，自然资源主管部门为耕地占用税的纳税人。耕地占用税是土地出让金的一部分，已经体现在招拍挂价格当中，契税的计税依据包含了耕地占用税。

情形二：由受让土地使用者缴纳

农用地转用审批文件中未标明建设用地人的，纳税人为用地申请人，用地申请人为各级人民政府的，纳税人为用地申请人，其中用地申请人为各级人民政府的，由同级土地储备中心、自然资源主管部门或政府委托的其他部门、单位履行耕地占用税申报纳税义务。

如自然资源管理局为用地申请人，即为耕地占用税的纳税人。如开发企业拍得该宗土地使用权，成为占用该地从事非农业建设的实际用地人，按照国有建设用地拍卖出让流程，由竞得人缴纳耕地占用税、契税，开发企业成为该宗地耕地占用税的实际税负人，由其将相当于耕地占用税额的价款支付给自然资源局，自然资源局给企业出具收款凭证，并向税务机关缴纳耕地占用税。即自然资源局征用耕地过程中即发生了耕地占用税的纳税义务，契税计税依据也已包含缴纳的耕地占用税。