本文结合税收风险管理实践，梳理了制造业企业在增值税方面的典型风险点，旨在帮助企业更好识别、评估和防范潜在的税务风险。

一、增值税纳税申报表填写错误案例:A公司系制造业增值税一般纳税人，2026年4月至12月取得铁路电子客票、航空运输电子客票行程单等票据，应抵扣旅客运输服务进项税额0.86万元，该公司每月申报时将该部分进项税额仅填写在《增值税及附加税费申报表附列资料(二)》(本期进项税额明细)的第10栏“(四)本期用于抵扣的旅客运输服务扣税凭证”中。主管税务局风险应对中发现此问题，A公司共被调整增加进项税额0.86万元，并予以退税，解析:在纳税申报时，财务人员对旅客运输服务的进项税额理解不准确，未能正确填列增值税申报表，导致应抵扣的进项税额未被抵扣，公司因此多缴了增值税。根据《增值税及附加税费申报表(一般纳税人适用))及其附列资料填写说明》规定，纳税人购进国内旅客运输服务，取得增值税专用发票、铁路电子客票、航空运输电子客票行程单，按规定可抵扣的进项税额，在申报时填写在《增值税纳税申报表附列资料（二）》“（一）认证相符的增值税专用发票”对应栏次中，才能真正实现抵扣。因为该表第 12栏“当期申报抵扣进项税额合计”=第1栏+第4栏+第11栏，而作为旅客运输服务进项税额单项列示的第 10 栏并未纳人计算，仅起了单项列明的作用。风险防范建议:增值税政策规定的调整结果，最终体现在《增值税及附加税费申报表(一般纳税人适用)》及其附列资料中，建议企业在认真学习增值税政策的同时，加强对增值税申报表填报口径的学习，确保准确填列申报表。


二、选择简易计税不符合规定条件案例:B公司系增值税一般纳税人，销售自产的商品混凝土选择简易办法计税。当订单任务繁忙时该公司外购商品混凝土直接对外销售，并与自产商品混凝土一并开具发票进行结算，均按照简易计税方法申报纳税。主管税务局风险应对中发现此问题，2023年9月B公司共被调整补缴增值税及附加28.3万元并按规定加收滞纳金。解析:根据《财政部 国家税务总局关于部分货物适用增值税低税率和简易办法征收增值税政策的通知》(财税〔2009〕9号)规定，一般纳税人销售自产的商品混凝土(仅限于以水泥为原料生产的水泥混凝土)可选择按照简易办法计算缴纳增值税。而B公司对销售外购的商品混凝土与自产的商品混凝土，一并按简易办法计税，造成少缴增值税。需要注意的是，增值税法已取消自产商品混凝土可选择简易计税政策，建筑材料相关的简易计税现行政策为：《关于增值税法施行后增值税优惠政策衔接事项的公告》（财政部 税务总局公告2026年第10号）规定，自2026年1月1日至2027年12月31日，一般纳税人销售自行采掘的建筑用和生产建筑材料所用的砂、土、石料，和以自行采掘的砂、土、石料或其他矿物连续自行生产的砖、瓦、石灰（不含粘土实心砖、瓦）可选择按照简易办法计算缴纳增值税。风险防范建议:增值税一般纳税人的计税方法以一般计税方法为原则，简易计税方法为例外。只有税收文件明确规定可以适用简易计税的项目，企业才能选择简易计税方法。同时，各项简易计税项目都设有明确的适用条件，不能超出规定的范围。在简易计税项目中，目前明确允许采用简易计税方法的直接购销行为共六项，具体包括:销售自来水，寄售商店代销寄售物品（包括居民个人寄售的物品在内），典当业销售死当物品，销售旧货，批发零售抗癌药品、罕见病药品，二手车经销的纳税人销售其收购的二手车。
三、农产品核定扣除办法执行不准确，重复抵扣进项税额案例:C公司系增值税一般纳税人，其主要业务是购进毛茶，加工生产销售精制茶。该公司执行农产品进项税额核定扣除政策。2021年C公司购进毛茶既取得增值税普通发票又取得增值税专用发票。C公司对当年取得的增值税专用发票全部勾选确认(含购进毛茶取得的增值税专用发票)。主管税务局风险应对中发现此问题，C公司共被调整补缴增值税及附加37.5万元，并按规定加收滞纳金。解析:根据《财政部 国家税务总局关于在部分行业试行农产品增值税进项税额核定扣除办法的通知》(财税〔2012〕38号)规定，试点纳税人购进农产品不再凭增值税扣税凭证抵扣增值税进项税额，其以购进农产品为原料生产货物的，农产品增值税进项税额可按照投人产出法、成本法、参照法计算核定C公司采用核定扣除方法计算当期允许抵扣的农产品增值税进项税额，不应凭增值税专用发票重复抵扣进项税额。风险防范建议:目前国家对农产品抵扣政策实行的是“两条腿”走路，一个是凭增值税扣税凭证抵扣增值税进项税额(简称凭票抵扣)，另一个是试行核定扣除。同一个制造业纳税主体，对于所有取得的初级农产品，要么凭票抵扣，要么试行核定扣除，不能选择部分农产品实行核定扣除，其余又凭票抵扣。需注意的是，当企业购进初级农产品并取得增值税专用发票时，由于日常习惯中倾向于勾选专票进行抵扣极易发生一并勾选抵扣的错误。为有效防范此风险建议企业加强对农产品税收政策的学习和理解，避免重复抵扣进项税额。
四、用于集体福利或个人消费项目的进项税额从销项税额抵扣案例:D公司系制造业增值税一般纳税人，将异地来本地任职的公司高管统一安排在公司附近的酒店住宿。对于这些住宿费，公司定期取得增值税专用发票并入差旅费核算，同时勾选抵扣了增值税进项税额。主管税务局风险应对中发现此问题，2026年8月D公司共被调整补缴增值税及附加11.4万元，并按规定加收滞纳金。解析:D 公司发生的从异地来任职的公司高管本地酒店住宿费用，实质属于集体福利的范畴，会计方面应按职工薪酬(非货币性福利)核算;增值税方面，该部分费用即使取得增值税专用发票也不得抵扣，因为根据《中华人民共和国增值税法》第二十二条第四项规定，购进并用于集体福利或者个人消费的货物、服务、无形资产、不动产对应的进项税额不得从其销项税额中抵扣。风险防范建议:制造业企业日常经营中，会发生许多具有明显集体福利或个人消费特征的支出，比如，取得个人出租住房1.5%征收率的增值税专用发票，取得酒店住宿增值税专用发票，购进烟、酒、保健品取得增值税专用发票(非购销用途)等，对这类支出所对应的进项税额不得从销项税额中抵扣，已经抵扣的，要作进项税额转出处理。
五、简易计税项目与一般计税项目共用的进项税额未转出案例:E公司系制造业增值税一般纳税人，兼营简易计税项目。2026年公司上市辅导费用属于公司共同费用，所含的进项税额全部勾选抵扣，未按规定作进项税额转出。主管税务局风险应对中发现此问题，2026年E公司共被调整补缴增值税及附加184.4万元，并按规定加收滞纳金。解析:E 公司发生除固定资产、无形资产、不动产之外的购进项目，既用于一般计税方法计税项目(以下简称一般计税项目)，又用于简易计税方法计税项目(以下简称简易计税项目)，根据《中华人民共和国增值税法》第二十二条第一项及《中华人民共和国增值税法实施条例》第二十三条规定，一般纳税人购进货物（不含固定资产）、服务，用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目和不得抵扣非应税交易而无法划分不得抵扣的进项税额的，应当按照销售额或者收入占比逐期计算当期不得抵扣的进项税额，并于次年1月的纳税申报期内进行全年汇总清算。
风险防范建议:一般计税项目和简易计税项目共同耗用的支出，常见的有公司审计费、代理费、总部水电费等，此类支出通常无法直接转出进项税额，应按规定的公式计算不得抵扣的进项税额。需注意的是，《增值税法实施条例》第二十三条在计算口径中增加了"不得抵扣非应税交易收入"，与旧规定相比更加全面，企业应关注这一变化。此外，固定资产、无形资产、不动产的混合用途处理适用《长期资产进项税额抵扣暂行办法》（财政部 税务总局公告2026年第15号）的特殊规则，不适用上述按比例分摊公式。
六、登记为一般纳税人之前购进项目的进项发票用于抵扣税款案例:F制造业公司开办初期购买设备部分取得增值税专用发票，开办当年已发生零星销售业务。次年，F公司登记为一般纳税人，在申报纳税时，将取得时间为一般纳税人之前的增值税专用发票进项税额直接勾选抵扣。主管税务局风险应对中发现此问题，F公司共被调整补缴增值税及附加4.6万元，并按规定加收滞纳金。解析:根据《国家税务总局关于纳税人认定或登记为一般纳税人前进项税额抵扣问题的公告》(国家税务总局公告2015年第59号)第一条规定，纳税人自办理税务登记至认定或登记为一般纳税人期间，未取得生产经营收入，未按照销售额和征收率简易计算应纳税额申报缴纳增值税的，其在此期间取得的增值税扣税凭证，可以在认定或登记为一般纳税人后抵扣进项税额。而F公司在开办第一年已经取得了销售收入，其在此期间购进项目的进项税额就不能抵扣。风险防范建议:根据《国家税务总局关于取消增值税扣税凭证认证确认期限等增值税征管问题的公告》(国家税务总局公告2019年第45号)规定，虽然对增值税一般纳税人取得 2017年1月1日及以后开具的增值税专用发票等税控扣税凭证取消认证申报抵扣的期限，但是对同一个纳税人在登记为般纳税人之前取得的增值税专用发票等，仍然有严格的前置条件，即在小规模纳税人期间，未取得生产经营收入，未按照销售额和征收率简易计算纳税对此，建议未在开业时点登记为一般纳税人的企业在开办初期要做好风险防范，要么控制好受票时间，要么在登记为一般纳税人之后开始销售，避免发生不必要的损失。
七、取得符合征税条件的财政补贴收入未申报缴纳增值税案例:G公司系制造业增值税一般纳税人，对从政府部门取得的与其销售产品数量挂钩的财政补贴收入，一直归入其他收益核算，同时按不征税收入申报处理。主管税务局风险应对中发现此问题，G公司2026年共被调整补缴增值税及附加31.5万元并按规定加收滞纳金。解析:G公司对财政补贴收入的处理，不符合《中华人民共和国增值税法》第十七条关于销售额的规定。该条规定，销售额，是指纳税人发生应税交易取得的与之相关的价款，包括货币和非货币形式的经济利益对应的全部价款，不包括按照一般计税方法计算的销项税额和按照简易计税方法计算的应纳税额。同时，国家税务总局公告 2019 年第 45 号第七条的规定，即纳税人取得的财政补贴收入，与其销售货物、劳务、服务、无形资产、不动产的收入或者数量直接挂钩的，应按规定计算缴纳增值税。风险防范建议:有关财政补贴的增值税处理，企业要准确划分补贴收入的类型。对于取得与其销售货物、服务、无形资产、不动产的收入或者数量直接挂钩的补贴收入，应按规定计算缴纳增值税；对于与销售收入或数量无直接关联的财政补贴（如科技研发专项补贴、无差别救济补贴等），不属于增值税应税收入，不征收增值税，但对应支出取得的进项税额需视情况判断是否可抵扣。
八、发生视同销售行为未申报缴纳增值税案例:H 制造业公司系增值税一般纳税人，2026年7月将自产商品作为职工福利发放，未按规定计人视同销售收入申报纳税。主管税务局风险应对中发现此问题，H公司2026年7月共被调整补缴增值税及附加1.3万元，并按规定加收滞纳金。解析:公司对以自产商品发放职工福利的处理应按照增值税法第五条规定，单位和个体工商户将自产或者委托加工的货物用于集体福利或者个人消费，属于视同应税交易，应按规定计算缴纳增值税。风险防范建议:有关视同应税交易的增值税处理，增值税法第五条进行了明确，企业应按规定确认增值税应税收入。
九、取得未按规定填写发票备注栏的增值税专用发票，违规抵扣进项税额案例:I公司系制造业增值税一般纳税人，2026年取得 12份未在发票备注栏注明相关货物运输信息的增值税专用发票，这些增值税专用发票所含的进项税额全部勾选抵扣。主管税务局风险应对中发现此问题，对其中无法红冲重新开具的部分调整补缴增值税及附加 12.1万元，并按规定加收滞纳金解析:根据《国家税务总局关于停止使用货物运输业增值税专用发票有关问题的公告》(国家税务总局公告 2015 年第 99号)第一条规定，增值税一般纳税人提供货物运输服务，使用增值税专用发票和增值税普通发票，开具发票时应将起运地、到达地、车种车号以及运输货物信息等内容填写在发票备注栏中如内容较多可另附清单。根据《中华人民共和国增值税法》第十六条第三款规定，纳税人应当凭法律、行政法规或者国务院规定的增值税扣税凭证从销项税额中抵扣进项税额。取得未按规定开具的增值税专用发票，属于不合规的扣税凭证，其进项税额不得从销项税额中抵扣。已抵扣的，应做进项税额转出处理。风险防范建议:国家出于税务管理和规范经济秩序的需要，对部分交易类别规范了有关填写发票备注栏的要求，制造业企业作为受票方，取得发票时要加强审核，及时将问题发票退回重开。常见的应填写备注栏的事项如下表所示:

十、无法提交证明交易真实发生的资料及凭据，失去按善意取得处理的机会案例:J公司从一家外地供应商购进了一批皮革，并按照合同约定通过银行转账支付货款共计20.8万元(含税)，同时取得1份增值税专用发票。然而，税务机关随后收到了异地协查的《已证实虚开通知单》，确认上述发票属于虚开。J公司因此被税务机关立案调查。尽管J公司向税务机关主张其属于善意取得，但由于证明交易真实性的资料及凭据全在业务员手中，而该业务员已在半年前辞职并失联，J公司无法提交相关资料及凭据，从而错失了按善意取得虚开增值税专用发票处理的机会，最终，J公司被税务机关要求补缴税款2.39万元并按规定加收滞纳金，同时处以补缴税款0.5倍的罚款。解析:根据《国家税务总局关于纳税人善意取得虚开的增值税专用发票处理问题的通知》(国税发〔2000〕187号)规定，认定善意取得的前提是购货方与销售方存在真实的交易。而交易的真实性需要通过交易合同、物流、付款凭证等证据资料加以佐证。这些资料对于交易双方来说至关重要，应当妥善保存。否则，一旦面临本案类似情况，企业可能会因为无法提供足够的证据而失去按善意取得处理的机会,从而承担滞纳金和罚款等不必要的损失，风险防范建议:企业发生购进业务时，务必保存能够证明业务真实性的关键证据。这些证据包括但不限于对方的营业执照副本及法定代表人身份证号码(以确保合作方的合法身份)、相关业务活动的正式合同或协议(作为双方权利和义务的明确依据)、非现金方式支付的付款凭证(如银行转账记录或电子支付截图，以证明资金流动的合法性)、货物运输的完整证明资料(如运单、签收单等，确保货物流转的透明性)，以及货物入库、出库的内部凭证(反映企业库存管理的规范性)。通过保存这些关键证据企业可以在面临类似情况时提供有力的证明，维护自身合法权益。(作者单位:国家税务总局黄山市税务局)(责任编辑:刘 珂)来源：《中国税务》2024年第5期，作者：李志春，严颖，由严颖根据增值税法及配套政策更新。上一版：案解制造业企业增值税典型风险点